A l'académie Kaimei, un club composé de 3 élèves, le Sket Dan, s'est fixé comme but de venir en aide à quiconque lui demande. Quelles que soient leurs capacités, ils auront du mal avec les drôles d'énergumènes qui viennent les voir. Et c'est sans compter le conseil des étudiants qui voit d'un mauvais oeil les activités, subversives à leurs yeux, de ce club. Chaque chapitre se concentre donc sur une mission avec des habitués qui reviennent de temps à autres.