La cave de fermentation est officiellement mise en route quand le professeur Itsuki et sa petite troupe commencent à produire du miso et de la sauce soja. Entre luttes féodales et Vietnam, les microbes sont sur le pied de guerre !
C´est alors qu´Oikawa découvre un mystérieux réseau de passages souterrains dans les sous-sols de l´université. Soupçonnant le professeur de mener des expériences dangereuses dans d´anciennes installations militaires, elle envoie Sawaki enquêter sur ce mystère...