Fin des années 1990, dix ans après la saison 3. Jotaro Kujo se rend dans la ville de Morio à la recherche de son oncle, fils illégitime d´un précédent Jojo. Au cours de son périple il se lie d´amitié avec un lycéen du nom de Josuke Higashikata qui s´avère être celui qu´il recherche. Jotaro va pouvoir le mettre en garde contre un manieur de Stand qui se cache dans sa ville.