L'espagnol Rodriguo Borgia, élu pape sous le nom d'Alexandre VI après de sombres machinations, se trouve face à une Rome en pleine décadence et à des oppositions grandissantes. Savanarole, à Florence, invective le peuple, des alliances politiques entre napolitains, français et espagnols sont montées pour que l'on procède à un nouveau conclave afin de destituer le souverain pontife pour hérésie.
Mais Rodriguo, conseillé par Machiavel, a un atout majeur entre ses mains : sa famille. Chacun de ses enfants, par des unions arrangées, pourra l'aider à conserver et à étendre son pouvoir.
Le clan Borgia évoque pour tous une image sulfureuse : les empoisonnements, César Borgia despote éclairé, Lucrèce beauté fatale et venimeuse ...